Эвгленовые водоросли (рис. 9) отличаются от других отделов водорослей чисто-зеленой окраской хроматофоров, содержащих хлорофиллы а и 5, каротин и ксантофилл. Форма клеток у этих водорослей большей частью удлиненная — эллипсовидная, веретеновидная и т. п. Размеры микроскопические. Целлюлозной оболочки нет; ее роль играет наружный уплотненный слой цитоплазмы, так называемый перипласт или пелликула; если он мягкий, гибкий, то клетки способны метаболически изменять форму тела. У немногих есть наружный твердый домик, или панцирь, обычно пропитанный солями железа, не прилегающий плотно к протопласту. Число и форма хроматофоров различны. Крахмала нет; запасной продукт — углевод парамилон — близок к крахмалу, но от йода не изменяет окраску или слегка желтеет; он откладывается в виде блестящих зерен в хроматофорах или вне их. На переднем конце тела находится воронковидное углубление, называемое часто (но ошибочно) «глоткой»; оно является выводным концом для системы сократительных вакуолей, находящихся возле него. От дна «глотки» отходит у большинства один длинный жгутик, выходящий из него далеко наружу. У некоторых видов водорослей этого отдела жгутиков два. У большинства имеется красный глазок. Движутся эвгленовые водоросли за счет метаболических изменений формы тела и плавают при помощи жгута, одновременно вращаясь вокруг продольной оси. Размножаются продольным делением клеток в подвижном или, чаще, в неподвижном состоянии. Половой процесс у них с достоверностью не установлен.
Рис. 9. Эвгленовые:1 — эвглена; 2 — трахеломонас; 9 — факус
Живут эвгленовые водоросли преимущественно в небольших пресных водоемах, богатых органическими веществами, где могут питаться миксотрофно, т. е. путем фотосинтеза и усвоения растворенных в воде органических веществ. Некоторые живут в солоноватых водоемах.
Эвгленовых водорослей насчитывают около 400 видов (25 родов).
Очень широко распространены представители большого рода эвглена (Euglena). Иногда, размножаясь в массовых количествах, эвглены окрашивают воду в небольших водоемах в зеленый или кроваво-красный цвет («цветение» воды); последнее обусловливается эвгленами, содержащими в протоплазме пигмент гематохром. Нередко встречаются виды факуса (Phacus).
Строение протопласта, наличие одного жгутика, отсутствие крахмала, замененного парамилоном, резко отличают эвгленовых от зеленых водорослей; это слепая ветвь эволюции